Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Def8Q99J78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Def8Q99J78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Def8Q99J78 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Def8Q99J78 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Def8Q99J78 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Def8Q99J78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Def8Q99J78 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms