Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc33a1Q99J27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc33a1Q99J27 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc33a1Q99J27 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc33a1Q99J27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc33a1Q99J27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc33a1Q99J27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc33a1Q99J27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc33a1Q99J27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc33a1Q99J27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms