Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc8b1Q925Q3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc8b1Q925Q3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc8b1Q925Q3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc8b1Q925Q3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc8b1Q925Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc8b1Q925Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms