Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cldn16Q925N4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn16Q925N4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn16Q925N4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn16Q925N4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn16Q925N4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn16Q925N4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms