Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sntg1Q925E1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sntg1Q925E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sntg1Q925E1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sntg1Q925E1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sntg1Q925E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sntg1Q925E1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms