Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prss28Q924N9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prss28Q924N9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prss28Q924N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prss28Q924N9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prss28Q924N9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prss28Q924N9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prss28Q924N9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prss28Q924N9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prss28Q924N9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prss28Q924N9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prss28Q924N9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prss28Q924N9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms