Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim59Q922Y2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim59Q922Y2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim59Q922Y2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim59Q922Y2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim59Q922Y2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim59Q922Y2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim59Q922Y2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trim59Q922Y2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trim59Q922Y2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms