Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc49Q91YK0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc49Q91YK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc49Q91YK0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc49Q91YK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc49Q91YK0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrc49Q91YK0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc49Q91YK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms