Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y20

Pcdha10, Protocadherin alpha-10, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha10Q91Y20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pcdha10Q91Y20 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pcdha10Q91Y20 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcdha10Q91Y20 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdha10Q91Y20 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha10Q91Y20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha10Q91Y20 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pcdha10Q91Y20 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha10Q91Y20 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms