Protein–RNA interactions for Protein: Q91XC9

Pex16, Peroxisomal membrane protein PEX16, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex16Q91XC9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pex16Q91XC9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pex16Q91XC9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pex16Q91XC9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pex16Q91XC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex16Q91XC9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pex16Q91XC9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pex16Q91XC9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex16Q91XC9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pex16Q91XC9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pex16Q91XC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pex16Q91XC9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms