Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdkal1Q91WE6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdkal1Q91WE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkal1Q91WE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkal1Q91WE6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkal1Q91WE6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkal1Q91WE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkal1Q91WE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms