Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd3Q91WC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Setd3Q91WC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Setd3Q91WC0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Setd3Q91WC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Setd3Q91WC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Setd3Q91WC0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Setd3Q91WC0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Setd3Q91WC0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Setd3Q91WC0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Setd3Q91WC0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms