Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Caskin2Q8VHK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Caskin2Q8VHK1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Caskin2Q8VHK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Caskin2Q8VHK1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Caskin2Q8VHK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Caskin2Q8VHK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Caskin2Q8VHK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Caskin2Q8VHK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms