Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cnot6lQ8VEG6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29,26■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Cnot6lQ8VEG6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cnot6lQ8VEG6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Cnot6lQ8VEG6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Cnot6lQ8VEG6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cnot6lQ8VEG6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Cnot6lQ8VEG6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Cnot6lQ8VEG6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47,8 ms