Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lmcd1Q8VEE1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lmcd1Q8VEE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lmcd1Q8VEE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lmcd1Q8VEE1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lmcd1Q8VEE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lmcd1Q8VEE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmcd1Q8VEE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmcd1Q8VEE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lmcd1Q8VEE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmcd1Q8VEE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms