Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3il1Q8VDV3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab3il1Q8VDV3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab3il1Q8VDV3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab3il1Q8VDV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab3il1Q8VDV3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab3il1Q8VDV3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rab3il1Q8VDV3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab3il1Q8VDV3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab3il1Q8VDV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms