Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,91■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,9■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
PpcsQ8VDG5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
PpcsQ8VDG5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,78■■□□□ 1,08
PpcsQ8VDG5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
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PpcsQ8VDG5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,76■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
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PpcsQ8VDG5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
PpcsQ8VDG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
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PpcsQ8VDG5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
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PpcsQ8VDG5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
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PpcsQ8VDG5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
PpcsQ8VDG5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PpcsQ8VDG5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PpcsQ8VDG5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PpcsQ8VDG5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
PpcsQ8VDG5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
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PpcsQ8VDG5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
PpcsQ8VDG5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
PpcsQ8VDG5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,56■■□□□ 1,04
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