Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alg12Q8VDB2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Alg12Q8VDB2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alg12Q8VDB2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alg12Q8VDB2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Alg12Q8VDB2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Alg12Q8VDB2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Alg12Q8VDB2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms