Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ubxn4Q8VCH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ubxn4Q8VCH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Ubxn4Q8VCH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,91■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Ubxn4Q8VCH8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Ubxn4Q8VCH8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Ubxn4Q8VCH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Ubxn4Q8VCH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ubxn4Q8VCH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Ubxn4Q8VCH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ubxn4Q8VCH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Ubxn4Q8VCH8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ubxn4Q8VCH8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,7 ms