Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MpdzQ8VBX6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MpdzQ8VBX6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MpdzQ8VBX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MpdzQ8VBX6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MpdzQ8VBX6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MpdzQ8VBX6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MpdzQ8VBX6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MpdzQ8VBX6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MpdzQ8VBX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MpdzQ8VBX6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MpdzQ8VBX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MpdzQ8VBX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms