Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
BbxQ8VBW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BbxQ8VBW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BbxQ8VBW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BbxQ8VBW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BbxQ8VBW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BbxQ8VBW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BbxQ8VBW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BbxQ8VBW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BbxQ8VBW5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms