Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdc16Q8R349 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc16Q8R349 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc16Q8R349 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdc16Q8R349 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdc16Q8R349 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdc16Q8R349 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc16Q8R349 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc16Q8R349 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc16Q8R349 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc16Q8R349 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc16Q8R349 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms