Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nup58Q8R332 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nup58Q8R332 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nup58Q8R332 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nup58Q8R332 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nup58Q8R332 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nup58Q8R332 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nup58Q8R332 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup58Q8R332 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup58Q8R332 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup58Q8R332 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms