Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gtf3c5Q8R2T8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gtf3c5Q8R2T8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gtf3c5Q8R2T8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gtf3c5Q8R2T8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gtf3c5Q8R2T8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gtf3c5Q8R2T8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gtf3c5Q8R2T8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.2 ms