Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nudcd3Q8R1N4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nudcd3Q8R1N4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nudcd3Q8R1N4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nudcd3Q8R1N4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudcd3Q8R1N4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nudcd3Q8R1N4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nudcd3Q8R1N4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nudcd3Q8R1N4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms