Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CipcQ8R0W1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CipcQ8R0W1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CipcQ8R0W1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CipcQ8R0W1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CipcQ8R0W1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CipcQ8R0W1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CipcQ8R0W1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CipcQ8R0W1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CipcQ8R0W1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CipcQ8R0W1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms