Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh3Q8K330 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssh3Q8K330 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssh3Q8K330 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssh3Q8K330 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssh3Q8K330 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh3Q8K330 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssh3Q8K330 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssh3Q8K330 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms