Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Brd3Q8K2F0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brd3Q8K2F0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brd3Q8K2F0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brd3Q8K2F0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brd3Q8K2F0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brd3Q8K2F0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brd3Q8K2F0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brd3Q8K2F0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms