Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mtmr3Q8K296 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mtmr3Q8K296 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mtmr3Q8K296 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mtmr3Q8K296 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mtmr3Q8K296 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mtmr3Q8K296 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Mtmr3Q8K296 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mtmr3Q8K296 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr3Q8K296 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mtmr3Q8K296 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr3Q8K296 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr3Q8K296 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mtmr3Q8K296 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms