Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcf3Q8K268 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcf3Q8K268 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcf3Q8K268 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcf3Q8K268 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcf3Q8K268 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcf3Q8K268 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcf3Q8K268 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcf3Q8K268 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms