Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neil3Q8K203 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Neil3Q8K203 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Neil3Q8K203 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Neil3Q8K203 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Neil3Q8K203 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Neil3Q8K203 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms