Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr1eQ8K202 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr1eQ8K202 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr1eQ8K202 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr1eQ8K202 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Polr1eQ8K202 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr1eQ8K202 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Polr1eQ8K202 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1eQ8K202 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr1eQ8K202 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms