Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S5

Klf11, Krueppel-like factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf11Q8K1S5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Klf11Q8K1S5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klf11Q8K1S5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klf11Q8K1S5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klf11Q8K1S5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klf11Q8K1S5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf11Q8K1S5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf11Q8K1S5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms