Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnppd1Q8K158 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnppd1Q8K158 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnppd1Q8K158 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnppd1Q8K158 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnppd1Q8K158 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnppd1Q8K158 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnppd1Q8K158 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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