Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc5a11Q8K0E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc5a11Q8K0E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc5a11Q8K0E3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a11Q8K0E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc5a11Q8K0E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc5a11Q8K0E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a11Q8K0E3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a11Q8K0E3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms