Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
Setd1bQ8CFT2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Setd1bQ8CFT2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Setd1bQ8CFT2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Setd1bQ8CFT2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Setd1bQ8CFT2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Setd1bQ8CFT2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Setd1bQ8CFT2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Setd1bQ8CFT2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Setd1bQ8CFT2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Setd1bQ8CFT2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Setd1bQ8CFT2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Setd1bQ8CFT2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Setd1bQ8CFT2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Setd1bQ8CFT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Setd1bQ8CFT2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Setd1bQ8CFT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Setd1bQ8CFT2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Setd1bQ8CFT2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Setd1bQ8CFT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Setd1bQ8CFT2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Setd1bQ8CFT2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Setd1bQ8CFT2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Setd1bQ8CFT2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Setd1bQ8CFT2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms