Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx8Q8CFD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx8Q8CFD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx8Q8CFD4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx8Q8CFD4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx8Q8CFD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx8Q8CFD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx8Q8CFD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms