Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc28bQ8CEG5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc28bQ8CEG5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc28bQ8CEG5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc28bQ8CEG5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc28bQ8CEG5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms