Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT5

4930415O20Rik, MCG18412, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930415O20RikQ8CDT5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930415O20RikQ8CDT5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930415O20RikQ8CDT5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930415O20RikQ8CDT5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930415O20RikQ8CDT5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930415O20RikQ8CDT5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930415O20RikQ8CDT5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms