Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc73Q8CDM4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc73Q8CDM4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc73Q8CDM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc73Q8CDM4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc73Q8CDM4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc73Q8CDM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc73Q8CDM4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc73Q8CDM4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc73Q8CDM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms