Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nhlrc3Q8CCH2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nhlrc3Q8CCH2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms