Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms