Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ephb1Q8CBF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb1Q8CBF3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb1Q8CBF3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb1Q8CBF3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb1Q8CBF3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ephb1Q8CBF3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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