Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrn3Q8CBC6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrn3Q8CBC6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrn3Q8CBC6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrn3Q8CBC6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrn3Q8CBC6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrn3Q8CBC6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrn3Q8CBC6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms