Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf21bQ8C966 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf21bQ8C966 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf21bQ8C966 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf21bQ8C966 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf21bQ8C966 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf21bQ8C966 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf21bQ8C966 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf21bQ8C966 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf21bQ8C966 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf21bQ8C966 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf21bQ8C966 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf21bQ8C966 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms