Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atxn7l2Q8C8K6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atxn7l2Q8C8K6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atxn7l2Q8C8K6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atxn7l2Q8C8K6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn7l2Q8C8K6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn7l2Q8C8K6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms