Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K6

Atxn7l2, Ataxin 7-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l2Q8C8K6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Atxn7l2Q8C8K6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,55■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Atxn7l2Q8C8K6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,51■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Atxn7l2Q8C8K6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Atxn7l2Q8C8K6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Atxn7l2Q8C8K6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Atxn7l2Q8C8K6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Atxn7l2Q8C8K6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms