Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Csgalnact2Q8C1F4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csgalnact2Q8C1F4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Csgalnact2Q8C1F4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csgalnact2Q8C1F4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Csgalnact2Q8C1F4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Csgalnact2Q8C1F4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Csgalnact2Q8C1F4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Csgalnact2Q8C1F4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Csgalnact2Q8C1F4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms