Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q3

Ttc34, Tetratricopeptide repeat protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc34Q8C0Q3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc34Q8C0Q3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc34Q8C0Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc34Q8C0Q3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc34Q8C0Q3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ttc34Q8C0Q3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc34Q8C0Q3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc34Q8C0Q3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc34Q8C0Q3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms