Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ythdf3Q8BYK6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ythdf3Q8BYK6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdf3Q8BYK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ythdf3Q8BYK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ythdf3Q8BYK6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ythdf3Q8BYK6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ythdf3Q8BYK6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ythdf3Q8BYK6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdf3Q8BYK6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdf3Q8BYK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ythdf3Q8BYK6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdf3Q8BYK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms