Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW41

Pomgnt2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pomgnt2Q8BW41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pomgnt2Q8BW41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pomgnt2Q8BW41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pomgnt2Q8BW41 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pomgnt2Q8BW41 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pomgnt2Q8BW41 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pomgnt2Q8BW41 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pomgnt2Q8BW41 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms