Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp4aQ8BU40 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nlrp4aQ8BU40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp4aQ8BU40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp4aQ8BU40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4aQ8BU40 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nlrp4aQ8BU40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nlrp4aQ8BU40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp4aQ8BU40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4aQ8BU40 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4aQ8BU40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp4aQ8BU40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms